Hanna Tuomisto er bredt interesseret i økologi og biogeografi af tropiske skove. Hun har gennemført omfattende feltarbejde i forskellige dele af det tropiske Amerika, især Amazonia, for at dokumentere plante-jord-forhold, rumlig variation i plantesamfunds sammensætning og biogeografiske mønstre på tværs af den tropiske regnskovs-biom. 

Idet hun har indsamlet prøver fra meget diverse skove over et helt kontinent, har Tuomisto anvendt og forfinet indikator-art tilgangen. Det betyder, at i stedet for at opgøre alle planter, fokuserer forskningen på en let identificeret plantegruppe, der kan tjene som en indikator for generelle floristiske og biogeografiske mønstre. Tuomistos yndlingsgruppe er bregnerne, for hvilke hun har etableret en omfattende økologisk og taksonomisk vidensbase. I sit DNRF Chair projekt vil hun arbejde tæt sammen med forskere med fokus på andre plantegrupper, især palmer og familien Melastomataceae, for at løse spørgsmål relateret til oprindelsen af den høje artsrigdom i troperne. For eksempel hvordan er artsdannelsesprocessen relateret til økologiske nicher, artstræk og biogeografien af arternes forekomst?